河道清淤整治方法有集成清淤方法、直吸式清淤、泥水分离等，具体方法如下：

1、集成清淤方法：在清淤环节要采用环保清淤方式，在环保、成本方面进行综合考虑，把多种清淤方式相结合。水力冲淤使得淤泥中的污染物扩散，所以要尽量的避免或者当河淤泥污染较轻的时候采用。机械清淤中的挖泥船挖泥清淤不但没有把淤泥中污染负荷很大的浮泥去除，反倒在清淤中搅动原本已沉积下来的污染物，使得污染扩散。

所以要根据实际在淤泥污染负荷较低的河道采用。人工冲淤也应要充分的考虑河道结构的现状及排泥条件。要大力推广生态清淤，在底泥污染负荷很大的时候，进行生态清淤降低污染负荷使至合适范围，然后进行水力的清淤或者机械式的清淤。

2、直吸式清淤：这是一种新的适合城镇河道的机械清淤方法，这种设备主要是利用伸到淤泥层内的吸头，使设备产生负压，从河底吸走淤泥。在吸头前要加一个过滤栅从而收集淤泥层中的垃圾，机械传动从河道中分离。这类设备除了把绝大部分的淤泥清除以外，还能把淤泥中的污染很严重的淤泥也除去，并可在配合使用泥降脱水的设备。这种装置能做成水上吸淤船以及水下清淤机器人形式，可不受河道宽度、水位以及横穿河道的构筑物等因素局限。

3、泥水分离：河道清淤提供在运输之前增加淤泥泥浆脱水、干化的工序。清淤出来的淤泥主要是泥浆水的形式，含水率一般在75%-90%之间。如果直接运输，运输量巨大，而且增加了单位河道的清淤成本。

而且，在运输的工程中泥浆水也容易泄漏，威胁到运输线路的环境。增加淤泥泥浆脱水、干化这一工序后，含水量就能降低到20%左右，淤泥泥浆水也变成泥块这样使得运输量减少了许多，而且泥浆水变成泥块后也方便了运输，大大减小了对运输线路环境造成的不利影响。对清淤过程中产生的多余的水应试污染程度采取不同的方法进行修复后再排入河道。